在葡萄酒生产过程中,使用元基因组AMPlicon测序对发酵Traminette葡萄的细菌群体进行分析
Adrienne Goppold1, Louis Conradie1, Otávio Guilherme Gonçalves de Almeida2
1A.R. Smith Department of Chemistry and Fermentation Sciences, Appalachian State University.
Journal of visualized experiments : JoVE
|December 18, 2023
概括
这项研究使用了16S amplicon测序来追踪Traminette葡萄在葡萄酒发酵过程中的细菌变化. 它确定了关键的细菌类和属,证实了测序.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 发酵科学 发酵科学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 葡萄和葡萄酒中的微生物群落显著影响发酵,产品开发和异味.
- 了解葡萄汁到最终葡萄酒的微生物动态在现场对于质量控制至关重要.
- 测序和生物信息学的进步使得可培养和不可培养微生物的全面分析成为可能.
研究的目的:
- 在发酵过程中和最终葡萄酒中分析Traminette葡萄末中的细菌群落.
- 研究不同营养补充剂对细菌动态的影响.
- 确认16S安普利康测序对监测酒中的细菌转移的有用性.
主要方法:
- 从葡萄末,发酵样品和最终葡萄酒中提取DNA.
- 16S rRNA 基因 (V4 超变区) 的安普利康序列.
- 生物信息分析包括Venn图,α多样性 (Kruskal-Wallis测试) 和β多样性分析.
主要成果:
- 已识别出主要的细菌系,包括蛋白质细菌 (Proteobacteria),活性细菌 (Actinobacteriota),固态细菌 (Firmicutes) 和杆菌 (Bacteroidota).
- 在葡萄末,发酵和葡萄酒阶段检测到15个常见的细菌类,包括以前未报告的细菌类和属 (例如,Enterobacteriaceae,Lactobacillaceae).
- 在营养处理之间在发酵过程中观察到明显的细菌转移,最终的葡萄酒细菌群体看起来相似.
结论:
- 在整个酒过程中,16S amplicon 测序对于监测细菌群体动态是有效的.
- 这项研究提供了有关Traminette葡萄酒发酵过程中营养变化的微生物转移的影响的见解.
- 这种方法支持加强质量控制和在葡萄生产中更好地利用葡萄相关细菌.
