转录组研究揭示了艾滋病病毒-1患者在ART前后的PBMC中的lncRNAs的变化
Yingying Zhou1, Yuqing Huang2, Xiaoping Chen1
1Department of Infectious Diseases, Zhongnan Hospital of Wuhan University, No. 169, Donghu Road, Wuchang District, Wuhan, 430071, Hubei Province, China.
Scientific reports
|December 18, 2023
概括
抗逆转录病毒疗法 (ART) 在HIV-1感染者中使许多长非编码RNA (lncRNAs) 正常化. 特定的lncRNAs,如CTB-119C2.1,表现出改变的表达,并可能影响HIV-1病原和治疗反应.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 病毒学 病毒学
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 长非编码RNAs (lncRNAs) 与HIV-1感染和病毒与宿主相互作用有关.
- 抗逆转录病毒疗法 (ART) 对HIV-1患者的lncRNA表达的影响在很大程度上是未知的.
研究的目的:
- 研究在ART开始前和之后,HIV-1患者的外周血液单核细胞 (PBMCs) 中 lncRNA表达的动态变化.
- 确定受ART影响的特定lncRNA,并探索它们在HIV-1病原发生中的潜在作用.
主要方法:
- 使用RNA测序 (RNA-seq) 和定量逆转录PCR (qRT-PCR) 来分析lncRNA表达特征.
- 进行了cis作用分析,以确定调节基因的lncRNAs.
- 基因和基因组的京都百科全书 (KEGG) 途径分析是在与差异表达的lncRNAs相关的基因上进行的.
主要成果:
- 在HIV-1患者中,ART治疗恢复了974个lncRNA的表达水平.
- 六个lncRNA被确定为cis调节基因,其中RP11-290F5.1和干扰素调节因子2 (IRF2) 已知可促进HIV复制.
- 在ART后,lncRNA CTB-119C2.1显著上调,并与参与p53信号通路,细胞周期和DNA复制的基因相关.
结论:
- 在感染HIV-1的个体中,ART诱导了lncRNA表达的动态变化.
- lncRNA CTB-119C2.1及其相关途径代表了进一步研究HIV-1病原和治疗策略的潜在目标.
