评估数据合并和获取后规范化对非定向高分辨率质谱基于尿液代谢数据的统计分析的影响

科学领域:

• 代谢学 代谢学 代谢学
• 分析化学 分析化学
• 生物流体分析分析

背景情况:

• 尿液是代谢研究的有价值的生物流体,由于非侵入性采集.
• 由于固有的样本度异质性,尿液代谢需要正常化.
• 电子喷雾电离 (ESI) 与质谱相结合,可以产生正负两种模式的数据.

研究的目的:

• 评估数据合并策略对尿液代谢学数据分析的影响.
• 为了比较不同合并程序下的八种收购后规范化方法的性能.
• 确定最佳方法来减少尿液中变异和保存生物信息.尿液代谢学.

主要方法:

• 一项比较性研究使用了来自食品链加 (FoCus) 队列的1029个尿样.
• 使用里埃转换离子循环子共振质谱法 (FT-ICR-MS) 进行测量.
• 基于五个标准的八种规范化方法的评估,包括规范化后的数据合并.

主要成果:

• 标准化后的数据合并通常提高了质量控制 (QC) 样本的相似性.
• 合并标准化后数据改善了样本分类和特征选择.
• 当数据在正常化后被合并时,概率系数正常化 (PQN) 的表现很好.

结论:

• 在尿液代谢学研究中,通常建议在正常化后将质谱数据合并.
• 在数据合并后应用时,概率系数规范化 (PQN) 是一种合适的方法.
• 依靠单个分析物来实现正常化,例如肌素,不太理想,尤其是在数据合并的情况下.