将全球微生物组数据纳入大型河流抗生素耐药性评估中
Fang-Zhou Gao1, Liang-Ying He1, You-Sheng Liu1
1SCNU Environmental Research Institute, Guangdong Provincial Key Laboratory of Chemical Pollution and Environmental Safety & MOE Key Laboratory of Theoretical Chemistry of Environment, South China Normal University, Guangzhou, China; School of Environment, South China Normal University, University Town, Guangzhou, China.
Water research
|December 19, 2023
概括
珍珠河的抗菌素耐药性 (AMR) 是广泛和多样化的,由废水和垃圾填埋场排放驱动. 这项研究强调了显著的AMR风险,特别是来自特定的基因和细菌,需要有针对性的监测.
科学领域:
- 环境微生物学环境微生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 公共卫生 公共卫生
背景情况:
- 河流是抗菌素耐药性 (AMR) 传播的关键途径.
- 在大型河流中评估AMR是复杂的,因为规模和多个污染源.
- 需要为河流抗体数据提供一个综合的全球框架.
研究的目的:
- 在中国珍珠河进行基于OMICs的AMR评估.
- 将河流的抗体与全球微生物组数据进行比较.
- 为了确定河流生态系统中的AMR风险和来源.
主要方法:
- 利用基于omics的方法来分析河水和沉积物中的AMR.
- 整合数据与全球微生物群数据集进行比较分析.
- 确定了特定的抗生素耐药性基因 (ARG) 和相关的细菌宿主.
主要成果:
- 珍珠河表现出高度多样化的抗生素耐药性,在某些地区超过全球基线.
- 污水处理厂的废水和垃圾填埋垃圾是AMR流行的主要驱动因素.
- 确定了54种高风险ARG,包括可调动的mcr和tet(X),与人/动物来源和高风险细菌相关.
- 抗佛罗芬尼科尔的floR和特定的ARG携带细菌 (例如,Enterobacteriaceae) 构成重大风险.
结论:
- 该研究提供了一种OMIC基准策略,用于评估大型河流中的AMR风险.
- 调查结果强调需要加强对世卫组织在河流系统中的优先病原体和ARG的监测.
- 了解河流中的AMR动态对于减轻公共卫生风险至关重要.
