在全球范围内感染 Botrytis cinerea 的四分段 ssDNA 病毒的分子特征

科学领域:

• 菌类学 菌类学是指菌类学.
• 病毒学 病毒学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 菌病毒家族Genomoviridae是新成立的,具有有限的特征成员,大多数诱导低毒性.
• 玻利菌片状DNA病毒1 (BcssDV1) 是一个四分段单链DNA病毒,感染菌玻利菌片状DNA病毒.

研究的目的:

• 执行BcssDV1.1.的第一个完整的测序和表征.
• 调查西班牙和意大利现场隔离物中BcssDV1的发病率和遗传多样性.
• 分析基因组段,编码的蛋白质及其潜在的功能.

主要方法:

• 在来自西班牙和意大利的Botrytis cinerea分离物中检测到BcssDV1.
• 使用NGS和桑格方法进行全基因组测序.
• 生物信息分析包括遗传学分析,三级蛋白质结构预测 (AlphaFold2,DALI).

主要成果:

• BcssDV1是一种四分段的ssDNA病毒 (DNA-A,DNA-B,DNA-C,DNA-D),每个部分大约为1.7Kb.
• 编码的蛋白质包括一个复制启动蛋白 (Rep),体蛋白 (CP) 和两个假设蛋白质.
• 在西班牙和意大利的隔离物中观察到高发病率和低变异性;DNA-A和DNA-D是保存的,而DNA-B和DNA-C是可变的.

结论:

• 这项研究首次对四分段的ssDNA真菌病毒进行了完整的表征.
• BcssDV1在西班牙和意大利广泛传播,在各地区都有显著的基因组保护.
• 蛋白质结构分析表明每个编码的蛋白质都有特定的功能作用.