一个用于活细胞内源性circRNA检测和生物成像的DNA八面体放大器及其生物标志物研究研究
Rong Feng1, Shengrong Yu1,2, Zhiling Qian1
1Institute of Mass Spectrometry, Zhejiang Engineering Research Center of Advanced Mass spectrometry and Clinical Application, School of Materials Science and Chemical Engineering, Ningbo University, Ningbo 315211, China. yushengrong@nbu.edu.cn.
The Analyst
|December 20, 2023
概括
研究人员开发了一种DNA八面体放大器,用于检测活细胞中的循环RNA (circRNA). 这种新方法可以实现精确的生物成像和circRNA生物标记物的检测,从而推进疾病诊断和治疗.
科学领域:
- 生物技术是生物技术.
- 分子生物学分子生物学
- 纳米技术纳米技术
背景情况:
- 循环RNAs (circRNAs) 显示为疾病诊断和预后的生物标志物具有前途.
- 目前在活细胞内*in situ*监测circRNA存在局限性,阻碍生物标志物的发展.
- 开发用于实时检测细胞中的circRNA的方法对于验证它们的诊断潜力至关重要.
研究的目的:
- 开发一种用于现场检测和生物成像活细胞中circRNAs的新平台.
- 使用基于催化针组件 (CHA) 的DNA八面体放大器 (DOA) 来增强信号检测.
- 通过与异常性肺纤维化 (IPF) 相关的circHIPK3作为目标生物标志物来验证平台.
主要方法:
- 用混合的光发针 (H1-Cy3,H2-Cy5) 制造一个DNA八面体.
- 通过目标circHIPK3.3的序列特定的背结 (BSJ) 激活催化针组合 (CHA) 反应.
- 使用光共振能量转移 (FRET) 从Cy3到Cy5进行信号检测和放大.
主要成果:
- 开发的DNA八面体放大器 (DOA) 能够快速放大circHIPK3.3的FRET检测.
- 该系统在各种细胞类型中证明了内源性circHIPK3的有效生物成像.
- DOA表现出优势,包括空间限制,核酶抵抗和细胞透性.
结论:
- 基于CHA反应的DOA为活细胞中circRNA检测和生物成像提供了一个高精度的测试平台.
- 这项技术克服了当前在*in situ*circRNA监测方面的局限性.
- 这些发现支持circRNAs作为早期疾病诊断和治疗策略的有价值生物标志物的潜力.
