加快蛋白质 - 配体相互作用的多重分析:以最小输入进行高通量板式反应性氨酸分析
Ka Yang1, Rebecca L Whitehouse1, Shane L Dawson1
1Department of Cell Biology, Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA.
Cell chemical biology
|December 20, 2023
概括
我们开发了一个新的高吞吐量平台,用于在蛋白质组中分析反应性半氨酸. 这种方法需要更少的输入材料,覆盖了更具反应性的部位,推进了化学蛋白质组学研究.
科学领域:
- 化学生物学 化学生物学
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
- 药物发现 药物发现 药物发现
背景情况:
- 化学蛋白质组学推进了小分子-蛋白质相互作用研究.
- 由于平台的局限性,对氨酸结合性的高通量蛋白质组范围的分析具有挑战性.
研究的目的:
- 引入一个改进的,基于板块的平台,用于高通量氨酸结合性概况.
- 为了能够通过减少输入和改善覆盖率对反应性半氨酸进行例行查询.
主要方法:
- 开发一种基于板块的新型化学蛋白质平台.
- 该平台的应用用于选本地HEK293T蛋白质组中的电友.
- 使用低输入量 (10-20μg) 进行全蛋白质组分析.
主要成果:
- 该平台可以在5-10倍的输入量下对约18,000-24,000个反应性半氨酸进行审讯.
- 在8,274个人类蛋白质中映射了38,450个反应性半氨酸的结合能力.
- 确定了KRAS抑制剂ARS-1620与腺氨酸激酶 (ADK) 的脱结合.
结论:
- 开发的平台显著提高了高通量蛋白质组范围的反应性半氨酸的评估.
- 这一进步有助于更深入地了解小分子相互作用和药物标识.
- 该平台为氨酸结合性分析提供了更深入和更完善的覆盖范围.
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