开放式存储库规模传播的最近邻居疑似光谱库用于非目标代谢学

科学领域:

• 代谢学 代谢学 代谢学
• 质谱测量质量谱测量
• 生物信息学是一种生物信息学.

背景情况:

• 未定位的代谢学产生了大量的双重质谱 (MS/MS) 数据,许多光谱仍然没有注释.
• 现有的光谱库不足以全面解释获得的MS/MS光谱.

研究的目的:

• 开发一个新的光谱库,以促进在非目标代谢学中解释未注释的MS/MS光谱.
• 通过利用结构关系和光谱相似性来改善代谢物识别.

主要方法:

• 创建一个最近的邻居嫌疑人的光谱库,包含87,916个注释的MS/MS光谱.
• 从未注释的光谱导出图书馆条目,通过分子网络与注释的光谱联系起来.
• 基于MS/MS频谱对齐和结构关系的注释的传播.

主要成果:

• 通过对乙卡尼丁,天然产品和药物代谢物进行注释,证明了广泛的适用性.
• 突出了图书馆在理解阿尔茨海默氏症大脑表型方面的实用性.
• 成功将数以百万计的光谱与潜在的分子身份联系起来.

结论:

• 最接近邻居的嫌疑人光谱图书馆显著增强了对非目标代谢学数据的解释.
• 这个资源为假设未知的MS/MS光谱的候选结构提供了一个有价值的工具.
• 通过GNPS平台的开放可用性促进了更广泛的采用,并加速了代谢学研究.