探索CPS-超推 DLPNO-CCSD ((T1) 基准值用于对酶催化反应的DFT方法进行基准测试.
Dominique A Wappett1, Lars Goerigk1
1School of Chemistry, The University of Melbourne, Parkville, Victoria 3010, Australia.
The journal of physical chemistry. A
|December 21, 2023
概括
基于域的局部对自然轨道合集群单双与扰动三倍[DLPNO-CCSD(T]计算可以通过完整的PNO空间 (CPS) 推断来增强,以获得更准确的基准值. 这种方法提高了有机酶模型的准确性,使得DLPNO-CCSD更适用于较大的系统.
科学领域:
- 计算化学的计算化学
- 量子化学 是一个量子化学.
- 方法开发 方法开发
背景情况:
- 基于域的局部对自然轨道合集群单双与扰动三倍 [DLPNO-CCSD(T]提供了一个高精度参考值的计算高效路线.
- 已提议对整个PNO空间 (CPS) 进行推断,以进一步提高DLPNO-CCSD计算的准确性.
- 密度功能近似 (DFA) 需要可靠的基准数据来验证,特别是对于复杂的系统,如酶活性位点.
研究的目的:
- 评估两个完整的PNO空间 (CPS) 外推水平,CPS (5,6) 和CPS (6,7) 对DLPNO-CCSD (T) 基准值的准确性的影响.
- 评估这些增强基准值如何影响有机和金属酶活性部位模型密度功能近似 (DFA) 的性能评估.
- 确定CPS抽象作为提高DLPNO-CCSD的准确性在基准测试中的成本效益高的方法的适用性.
主要方法:
- 应用DLPNO-CCSD ((T) 计算与CPS ((5,6) 和CPS ((6,7) 推断到有机和过渡金属依赖酶活性部位模型.
- 对各种密度函数近似 (DFA) 与生成的高级参考数据进行比较.
- 通过使用CPS-extrapolated参考值对有机酶活性部位模型的ENZYMES22数据集重新评估DFA性能.
主要成果:
- 虽然CPS推断改变了DFAs的绝对偏差大小,但相对排名在很大程度上保持一致.
- 与有机酶相比,金属酶的DFA性能差异更为明显.
- 对于参考值,使用CPS推断对有机酶的总体基准测试结果的影响微不足道.
结论:
- 建议使用CPS (5,6) 推断作为用于生成DLPNO-CCSD (T) 参考值的标准TightPNO设置的实际替代方案.
- 通过CPS外推,DLPNO-CCSD的提高准确性提高了其适用于比较较大的有机酶模型的适用性.
- 作为改进的参考数据,提供了ENZYMES22集的最新DLPNO-CCSD(T1)/CPS(6,7) 能量.


