来自埃塞俄比亚中部,东部和东南部的Mycobacterium tuberculosis隔离物的遗传多样性
Mulualem Agonafir1, Gurja Belay1, Nontuthuko E Maningi2
1Department of Microbial, Cellular and Molecular Biology, College of Natural Sciences, Addis Ababa University, Ethiopia.
Heliyon
|December 21, 2023
概括
埃塞俄比亚 埃塞俄比亚 埃塞俄比亚
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 遗传学 是一个遗传学.
- 流行病学 流行病学
背景情况:
- 埃塞俄比亚的Mycobacterium结核复合体 (MTBC) 种群结构多样化,主要包括欧美 (第4系) 和东非-印度 (第3系) 血统.
- 了解MTBC的遗传多样性对于有效的结核病控制战略至关重要.
研究的目的:
- 描述埃塞俄比亚中部,东部和东南部的MTBC分离物的遗传多样性.
- 为了确定在研究区域中占主导地位的MTBC血统和spoligotypes.
主要方法:
- 来自阿达马和哈拉尔结核病参考实验室的223个MTBC培养分离物的spoligotyping.
- 收集患者的人口和临床特征.
主要成果:
- 欧美 (75.3%) 和东非-印度 (19.3%) 血统占主导地位,占孤立的94.6%.
- 鉴定了77种独特的spoligotype模式,其中SIT149/T3_ETH,SIT53/T1,SIT21/CAS1_Kili和SIT41/Turkey是最常见的.
- 在埃塞俄比亚东部检测到一种罕见的北京聚类型 (SIT541),并观察到71.3%的聚类率,年龄组 (25-34) 与聚类有显著的关联.
结论:
- 埃塞俄比亚的MTBC种群呈现异质性,在欧美血统中由T和CAS家族主导.
- 罕见的北京菌株 (SIT541) 的存在需要加强监测和进一步调查.
- 建议进行全基因组测序,以全面了解MTBC遗传多样性,以指导控制工作.
关键词:
埃塞俄比亚 埃塞俄比亚 埃塞俄比亚遗传多样性 遗传多样性血统 血统 血统 血统 血统 血统 血统结核菌菌菌菌复合体 结核菌菌结核菌复合体在Spoligotyping中,使用的是Spoligotyping.一个子系子系.更多相关视频
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