宿主-客户系统的SAMPL9盲目的预测挑战:西作为一个有特权的支架,用于结合环氧素
Brenda Andrade1, Ashley Chen1, Michael K Gilson1
1Skaggs School of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences, University of California, San Diego, 9255 Pharmacy Lane, La Jolla, CA 92093, USA. mgilson@health.ucsd.edu.
Physical chemistry chemical physics : PCCP
|December 21, 2023
概括
提亚类药物强烈地与环氧素结合,其中一些相互作用比已知的高亲和度结合剂更强. 循环德克斯的甲基化可以取消结合,揭示药物发现的非共价相互作用的模式.
科学领域:
- 计算化学计算化学
- 超分子化学 超分子化学
- 药物发现 药物发现 药物发现
背景情况:
- 主机-客户系统对于开发和验证药物发现中的计算方法至关重要.
- 氨酸作为与β-cyclodextrin (βCD) 和其衍生物结合的特权支架而出现.
- SAMPL (分子性质的统计分析) 预测挑战利用主机-客户系统.
研究的目的:
- 描述表诺提亚药物与原生和甲基化β-环极素 (βCDs) 的非共价关联.
- 研究βCD甲基化对结合亲和力和结合方式的影响.
- 为SAMPL9具有约束力的预测挑战提供数据,并探索潜在的应用.
主要方法:
- 热量测量被用来测量结合热力学.
- 核磁共振 (NMR) 光谱法被用来阐明结合模式和相互作用.
- 研究了五种类药物和原生/甲基化βCD衍生物.
主要成果:
- 在 thioridazine 和甲基化βCD衍生物之间观察到的最强的结合,超过了rimantidine-βCD亲和力.
- 在3-位置的βCD的甲基化完全消除了所有研究药物的可检测结合.
- 在具有约束力的数据中观察到一种明显的-补偿模式.
- 核磁共振数据显示药物的芳香质子与βCD的二次面相互作用,深部透.
结论:
- 氨酸和类似的药物 (例如三环抗抑郁药) 是βCD的强有力的结合剂.
- βCD的特定甲基化模式显著影响结合亲和力.
- 这些发现支持未来的SAMPL挑战数据集,并建议作为药物逆转剂的潜在应用.
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