MBDBMetrics:一种在线指标工具,用于测量生物数据资源的影响
Giuseppe Insana1, Alex Ignatchenko1, Maria Martin1
1European Molecular Biology Laboratory, European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), Wellcome Genome Campus, Hinxton CB10 1SD, United Kingdom.
Bioinformatics advances
|December 22, 2023
概括
一个新的工具MBDBMetrics为分子生物学数据库提供了新的影响指标. 它分析了全文文章,赠款确认和专利,以向资助者展示资源的重要性.
科学领域:
- 生物信息学是一种生物信息学.
- 数据库管理数据库管理
- 科学沟通科学沟通
背景情况:
- 数以千计的分子生物学数据库需要大量的资金和努力来开发和维护.
- 数据库创建者需要强大的指标来证明它们对资助者的影响和重要性.
- 像引用数和AltMetrics这样的现有指标提供了对数据库影响的部分视图.
研究的目的:
- 为分子生物学数据库引入新的影响指标.
- 提供一个工具,MBDBMetrics,增强数据库意义的评估.
- 为了使任何分子生物学资源能够获得额外的影响指标.
主要方法:
- 开发了利用欧洲PubMed Central和SureCHEMBL的API开发的新型影响指标.
- 最初将这些指标应用于UniProt数据库.
- 创建了一个Google Colab笔记本,以实现广泛的可访问性和应用.
主要成果:
- MBDBMetrics量化了在全文文章中提到的分子生物学资源,包括特定的部分.
- 该工具跟踪授予确认和专利申请中的提及.
- 这些指标是现有的影响评估工具的宝贵补充.
结论:
- MBDBMetrics提供了一种全面的方法来评估分子生物学数据库的影响.
- 该工具增强了数据库创建者向资助者展示价值的能力.
- 自由可用的API和谷歌 Colab平台确保了广泛的实用性和可访问性.
