一个高效的CRISPR/Cas9基因组编辑系统用于Ganoderma lucidum通过Ribonucleoprotein方法培养的菌株
Yi Tan1, Xianglin Yu2, Zhigang Zhang3
1National Engineering Research Center of Edible Fungi, Institute of Edible Fungi, Shanghai Academy of Agricultural Sciences, Shanghai 201403, China.
Journal of fungi (Basel, Switzerland)
|December 22, 2023
概括
这项研究优化了CRISPR/Cas9核糖蛋白 (RNP) 基因组编辑系统,实现了100%的准效率和 ura3 基因的高编辑率. 该系统可实现有针对性的繁殖和代谢调节.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 菌类学 菌类学是指菌类学.
- 生物技术是生物技术.
背景情况:
- CRISPR/Cas9是一种流行的基因组编辑工具.
- рибо核蛋白 (RNP) 复合体比基于等离子体的系统具有优势,但报告的效率较低.
- 对于Ganoderma lucidum,需要有效的基因组编辑系统.
研究的目的:
- 开发和优化一种RNP介导的CRISPR/Cas9基因组编辑系统,用于Ganoderma lucidum.
- 为了提高编辑效率和目标在G. lucidum.
- 研究CRISPR/Cas9诱导的双链断裂后的DNA修复机制.
主要方法:
- 开发了一种RNP介导的CRISPR/Cas9系统,用于Ganoderma lucidum L1菌株.
- 使用含有5-酸 (5-FOA) 的选择性介质进行选择.
- 分析了基因编辑结果,包括插入,替代和DNA修复途径 (NHEJ和MMEJ).
主要成果:
- 在基因组编辑中实现了100%的准效率.
- 获得了高编辑效率的奥托丁5'-单酸脱碳酶 (ura3) 基因 (>35突变体/10^7原生体).
- 具有特征的DNA修复,其中94.4%的突变使用非同源端连接 (NHEJ) 和5.6%使用微同源介导端连接 (MMEJ).
- 成功编辑了其他G. lucidum基因 (cyp512a3,cyp5359n1).
结论:
- 优化的RNP-CRISPR/Cas9系统在Ganoderma lucidum基因组编辑方面非常有效.
- 这种系统促进了G. lucidum的有针对性的繁殖和合成代谢调节.
- 这项研究为G. lucidum. 的DNA双链断裂修复机制提供了洞察力.


