用全基因组测序对干的卵生产特征进行全基因组协会研究
Ming Fu1,2, Yan Wu1,2, Jie Shen1,2
1Institute of Animal Husbandry and Veterinary, Hubei Academy of Agricultural Science, Wuhan 430064, China.
Genes
|December 23, 2023
概括
在全基因组分析中,发现了显著的SNP和候选基因,用于Shuanglian的卵生产特征. 这项研究有助于理解和改善卵数量,体重和产卵持久性.
科学领域:
- 动物遗传学动物遗传学
- 禽畜科学 禽畜科学 禽畜科学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 产卵生产特征对于产母的经济可行性至关重要.
- 识别遗传标记可以促进标记辅助的选择,以改善家禽的繁殖.
研究的目的:
- 在中进行全基因组关联研究 (GWAS),以确定关键卵生产特征的分子标记物和候选基因.
- 分析卵子生产特征的遗传性和链接不平衡.
主要方法:
- 整个基因组测序 (WGS) 是在Shuanglian上进行的.
- 进行了质量控制和单核酸多态化 (SNP) 调用,产生了超过1100万个SNP.
- 使用全基因组关联研究 (GWAS) 和链接不平衡 (LD) 分析.
主要成果:
- 卵子重量 (EW) 和最大连续产卵日 (MCD) 的遗传概率估计为中等至高,而第一卵 (AFE) 的年龄,第一卵 (WFE) 的体重和卵数 (EN) 的低至中等.
- GWAS确定了11个全基因组显著的SNP和23个与EN,MCD,WFE和EW相关的显著SNP.
- 在LD分析中,在GGA10上的0.57Mb区域内确定了27个与EN相关的SNP,并确定了候选基因,包括NEO1,ADPGK,CYP11A1 (用于EN),S1PR4 (用于MCD),LDB2 (用于WFE) 和GRM8 (用于EW).
结论:
- 该研究成功地确定了与关键蛋生产特征相关的显著SNP和候选基因.
- 这些发现为了解蛋生产的分子基础以及未来的家禽遗传改进计划提供了宝贵的遗传资源.
