查林常见野生大米 (Oryza rufipogon Griff.) 中Callus Browning的遗传和转录组分析

科学领域:

• 植物遗传学 植物遗传学
• 分子生物学分子生物学
• 农业科学 农业科学

背景情况:

• 在印加大米中,的棕色化阻碍了用于育种和基因功能研究的基因转换.
• 这种色取决于特定的水基因型.

研究的目的:

• 识别控制印加大米中色的遗传因素.
• 提高米育种和研究的基因转换效率.

主要方法:

• 分析了124条入侵线 (HCL) 使用2059个SNP进行定量特征位置 (QTL) 映射.
• 在低色线上进行RNA测序 (RNA-seq),并将间隔映射与加权基因共表达网络分析结合起来.
• 利用基因本体学 (GO) 分析来了解所涉及的生物途径.

主要成果:

• 确定了两个主要的QTLs,即7号染色体上的qCBT7和10号染色体上的qCBT10,与状色相关.
• 发现了三种上调的候选基因 (Os07g0620700,Os10g0361000,Os10g0456800),可能是Oryza rufipogon.唯一的.
• 发现的色可能与乙烯和激素信号通路有关.

结论:

• 已识别的QTL和候选基因为克隆和改善大米遗传转换提供了基础.
• 了解色的遗传基础可以提高印加大米的基因编辑辅助育种.