构建病原性微生物的交互和综合分析和识别平台,以支持监测能力
Yang Song1, Songchao Zhong2, Yixiao Li2
1National Key Laboratory of Intelligent Tracking and Forecasting for Infectious Diseases, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Beijing 102206, China.
Genes
|December 23, 2023
概括
这项研究引入了一个在线平台来分析病原体基因组数据,简化了全基因组测序 (WGS) 分析的公共卫生专业人员. 该工具使非程序员能够进行复杂的数据挖掘,用于传染病监测.
科学领域:
- 生物信息学是一种生物信息学.
- 基因组学就是基因组学.
- 流行病学 流行病学
背景情况:
- 全基因组测序 (WGS) 对于追踪病原体起源和在疫情期间传播至关重要.
- 临床和公共卫生专家在有效利用微生物组测序数据方面面临着挑战.
- 需要可访问的工具来分析病原体基因组数据,用于公共卫生监测.
研究的目的:
- 为病原体基因组数据分析开发一个动态,互动的在线平台.
- 为公共卫生专业人员提供易于使用的传染病监测工具.
- 为了促进病原体基因组数据的深入分析和利用,而不需要编程专业知识.
主要方法:
- 该平台使用Java和VUE框架构建,采用MVC模式.
- 云计算服务被用来整合生物信息分析工具.
- 该系统为数据分析和结果生成提供了一个交互式视觉接口.
主要成果:
- 该平台能够对病原体基因组数据进行非编程分析.
- 用户可以通过网页交互设置参数,以获得视觉分析结果.
- 结果可以以各种格式出口,以支持进一步的研究.
结论:
- 已经建立了一个交互式在线生物信息学分析平台.
- 复杂的基因组分析过程通过基于云的服务来简化.
- 该平台为公共卫生专业人员提供实时数据挖掘和分析.


