抗菌剂在传统养场和天然养场中的使用对微生物群和耐药性的影响

科学领域:

• 微生物学与环境科学 微生物学与环境科学
• 畜牧健康和食品安全问题
• 基因组学和生物信息学

背景情况:

• 在牲畜中使用抗微生物药物 (AMU) 与抗微生物药物耐药性 (AMR) 的增加有关.
• 肉牛行业正在看到禁止使用抗生素的"天然"养区的增长.
• 了解AMU对微生物群落和耐药基因的长期影响至关重要.

研究的目的:

• 调查AMU在养场牛对便微生物群,抗体和移动体的影响.
• 为了比较自然 (没有AMU) 和传统 (AMU) 养殖的料场牛之间的微生物和遗传特征.
• 评估抗微生物耐药性基因 (ARG) 在自然生产系统中的持久性.

主要方法:

• 枪支元基因组测序被用来分析便和捕捞盆地样本.
• 分析了微生物组的组成,重点关注特定的细菌.
• 耐药性和移动性的特点是通过识别抗菌素耐药性基因 (ARG) 和它们的位置 (等离子体与染色体) 来进行鉴定.

主要成果:

• 便样本显示,自然养的牛中甲生物菌和特雷波尼马的数量显著下降.
• 在自然和常规料区之间没有观察到类级抗体的显著差异.
• 在自然生长的牛便中,特定的ARG (*mef*A, *tet*40, *tet*O, *tet*Q, *tet*W) 减少.
• 与等离子体相关的ARG在传统养场便中更为普遍.
• 在这两种系统中,染色体宏化物耐药性基因比与等离子体相关的基因更为丰富.

结论:

• 几十年的AMU已经在料场环境中建立了持久的抗体.
• 这些抗体随着时间的推移而被选择,即使在自然生产系统中AMU停止后,仍然可以检测到.
• 这些发现凸显了农业AMU对微生物生态和耐药性基因库的长期影响.