敏感的小麦基因型的内核转录组概况,以应对小麦矮子的撞击
Shenqiang Su1,2, Zihao Zhang1,2, Tong Shen1,3
1Key Laboratory of the Pest Monitoring and Safety Control of Crops and Forests of the Xinjiang Uygur Autonomous Region, College of Agronomy, Xinjiang Agricultural University, Urumqi 830052, China.
International journal of molecular sciences
|December 23, 2023
概括
小麦矮子突变 (TCK) 导致核的异常发育. RNA测序确定了差异表达的基因,包括转录因子和激素信号基因,对于理解小麦TCK感染至关重要.
科学领域:
- 植物病理学 植物病理学
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 麦子矮,由 *Tilletia controversa* J. G. Kühn (TCK) 引起,是一种影响小麦核发育的重要真菌病.
- 了解TCK诱导的内核异常背后的分子机制对于开发有效的管理策略至关重要.
研究的目的:
- 为了确定参与TCK感染导致小麦粒异常发育的候选基因.
- 分析小麦核转录组在不同的发育阶段对TCK的反应.
主要方法:
- 用RNA测序来比较健康和TCK感染的易受性小麦核 (Yili053) 的转录组在中填充,晚填充和成熟阶段.
- 进行了差异基因表达分析,基因本体学 (GO) 丰富和基因和基因组的京都百科全书 (KEGG) 途径分析.
- 使用定量实时PCR (qPCR) 来验证所选基因的表达.
主要成果:
- 数以千计的差异表达基因 (DEGs) 在三个阶段被确定,其中1592个DEGs被持续改变.
- 丰富的途径包括光合作用,碳代谢和植物激素信号传递.
- 13个持续上调的MADS-MIKC转录因子和21个植物激素信号基因被确定为潜在的关键.
结论:
- 该研究确定了关键的基因和途径,涉及TCK诱导的异常小麦核发育.
- 转录基因洞察力为了解小麦-TCK相互作用和开发有针对性的疾病管理方法提供了基础.
