构建风险预后模型与HCC中脱硫脱症 lncRNAs相关
Xiao Jia1, Yiqi Wang1, Yang Yang1
1State Key Laboratory of Medicinal Chemical Biology, College of Pharmacy and Tianjin Key Laboratory of Molecular Drug Research, Nankai University, Tianjin 300000, China.
International journal of molecular sciences
|December 23, 2023
概括
不硫化,一种新的细胞死亡,通过长非编码RNA (lncRNAs) 与肝细胞癌 (HCC) 有关. 使用6个lncRNA的新预后模型预测HCC患者的结果和潜在的治疗反应.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 细胞死亡研究 细胞死亡研究
背景情况:
- 脱硫脱症是一种由二硫化物键积累驱动的编程细胞死亡的新发现模式.
- 长非编码RNAs (lncRNAs) 在肝细胞癌 (HCC) 中失调,并显示出作为预后生物标志物的前景.
- 关于lncRNAs与HCC中脱硫解症之间的相互作用的研究有限.
研究的目的:
- 开发基于与二硫化相关的 lncRNAs 的 HCC 预后风险模型.
- 探索HCC中二硫化的潜在机制.
- 为了确定HCC的潜在治疗点和生物标志物.
主要方法:
- 利用癌症基因组图谱 (TCGA) 数据库,获取424名HCC患者的临床和转录数据.
- 通过皮尔森相关性分析确定了1668个与二硫化相关的lncRNAs.
- 使用Cox比例危险和LASSO回归构建了一个六个lncRNA风险模型,通过Kaplan-Meier分析,PCA,ROC曲线和C指数进行验证.
主要成果:
- 一个六个lncRNA的预后模型被成功开发和验证为HCC患者生存的独立预测器.
- 该模型有效地将患者分为不同的风险组,与免疫细胞透,药物敏感性和免疫治疗反应相关.
- 含有1个反感RNA1 (PLBD1-AS1) 和肌肉蛋白1个反感RNA (MKLN1-AS) 的脂酶B域被确定为HCC中高度表达和潜在的生物标志物.
结论:
- 与二硫化相关的lncRNAs可以作为预测HCC预后的有价值的生物标志物.
- 开发的风险模型为患者分层和HCC的潜在治疗策略提供了洞察力.
- 作为HCC的潜在治疗点,PLBD1-AS1和MKLN1-AS值得进一步研究.
