一个与致病性相关的可转移元素最近的重新激活与一种真菌小麦病原体的主要染色体重组有关
Thomas Badet1, Sabina Moser Tralamazza1, Alice Feurtey1,2
1Laboratory of Evolutionary Genetics, Institute of Biology, University of Neuchâtel, CH-2000 Neuchâtel, Switzerland.
像斯蒂克斯元素这样的可转移元素驱动基因组变异. 这项研究追踪了斯蒂克斯元素.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 进化生物学 进化生物学
- 菌类遗传学 菌类遗传学
背景情况:
- 可转移元素 (TE) 对基因组变异和适应有显著的贡献.
- 进化史和TEs在物种中的插入模式尚未完全理解.
- 斯蒂克斯元素与真菌病原体的病原性有关.
研究的目的:
- 调查斯蒂克斯种类的可转移元素的进化起源和传播.
- 分析Zymoseptoria tritici.中斯蒂克斯元素的插入动态和转移活动.
- 了解树元素活动对染色体完整性和疾病表达的影响.
主要方法:
- 遗传学分析以追踪五种物种中斯蒂克斯元素的起源.
- 900个Zymoseptoria tritici分离物的全基因组测序,以评估Styx副本数量的变化.
- 在四代人的祖先分析中,观察了斯蒂克斯的动员和新插入.
- 基因组分析以确定首选的插入位和相关的染色体重排.
主要成果:
- 斯蒂克斯元素很可能起源于Zymoseptoria属,并多次重新激活.
- 在大洋洲和南美洲,在Zymoseptoria tritici.中检测到新的Styx转移活动.
- 新斯蒂克斯副本不会被基因组防御抑制,这表明宿主控制最小.
- 刺插入经常发生在重组断点,可能导致染色体重组.
结论:
- 该研究确定了高度活跃的Styx TE的起源,多样化和重新激活.
- 斯蒂克斯元素的活性对染色体完整性和病原性有重大影响.
- 了解TE动态对于理解病原体进化和适应至关重要.
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