禽类加工干预措施通过深度血型鉴定来确定冷后的幼尸体上的沙门氏菌血清复杂性
Amber K Richards1, Amy T Siceloff1, Mustafa Simmons2
1Department of Population Health, University of Georgia, Athens, GA, USA.
Journal of food protection
|December 24, 2023
概括
使用CRISPR-SeroSeq进行深度血型鉴定显示,肉加工显著降低了沙门氏菌血清多样性. 这种先进的方法准确地识别了多个血清病毒,显示干预措施有效降低了复杂性.
科学领域:
- 食品安全 食品安全
- 微生物学 微生物学
- 兽医科学 兽医科学 兽医科学
背景情况:
- 沙门氏菌是严重的公共卫生问题,肉导致了近20%的病例.
- 由于单个殖民地选择,传统的沙门氏菌培养方法可能会错过稀少的血清病毒.
- 减少家禽中的沙门氏菌污染对公共卫生和食品工业至关重要.
研究的目的:
- 采用深度血型鉴定方法,CRISPR-SeroSeq,在加工过程中分析肉肉中的沙门氏菌血清复杂性.
- 评估抗微生物干预对沙门氏菌血清菌群动态的影响.
- 为了比较深度血型鉴定与传统方法的有效性.
主要方法:
- 在美国各地收集了配对的热回响和冷却后的年轻尸样本.
- 应用CRISPR-SeroSeq (通过测序聚类定期间隔的帕林德罗姆重复进行血型定型) 对沙门氏菌阳性样本.
- 在处理干预之前和之后分析了血清细胞的多样性和流行率.
主要成果:
- 在48.4%的热样本中检测到多个沙门氏菌血清型,而在冷后的样本中则为7.9%.
- 热的尸体平均为1.6个血清器,而冷后的尸体平均为1.1个血清器 (p=0.00018).
- CRISPR-SeroSeq与传统方法具有很高的一致性 (98.4%),并解释了配对样本中的差异.
结论:
- 肉加工干预措施显著降低了沙门氏菌血清菌的复杂性和多样性.
- 与传统方法相比,CRISPR-SeroSeq提供了更全面的了解沙门氏菌种群.
- 抗微生物干预措施有效地简化了在家禽加工中沙门氏菌血清群的局面.
