针对犬类淋巴瘤的TiHoCL小组:一个可行性研究,集成功能基因组学和网络生物学方法,用于比较瘤向的NGS小组设计

科学领域:

• 兽医瘤学 兽医瘤学
• 基因组学就是基因组学.
• 比较医学是一种比较医学.

背景情况:

• 目标下一代测序 (NGS) 已经彻底改变了个性化的人类瘤学.
• 兽医经常采用新技术,速度比人类医学慢,但正在进步.
• 人类疾病的洞察力可以为兽医医学研究提供信息.

研究的目的:

• 提出一种概念验证,用于开发使用人类数据的兽医向NGS面板.
• 介绍TiHoCL针对性NGS小组用于犬类淋巴瘤 (CL) 的表征.
• 证明功能基因组学和网络方法在兽医研究中的实用性.

主要方法:

• 根据人类非霍奇金淋巴瘤 (NHL) 研究,为TiHoCL小组选择了100个单核酸多态 (SNP).
• 利用功能性基因组学和网络方法从人类血液恶性瘤数据中进行SNP选择.
• 通过使用Ion TorrentTM PGM系统对29名犬类淋巴瘤患者的DNA进行测序,验证了TiHoCL面板.

主要成果:

• TiHoCL面板在技术上经过验证,并使用了良好的测序运行指标.
• 证明了利用人类NHL研究对兽医CL遗传学的可行性.
• 该小组有助于表征和分层狗淋巴瘤患者.

结论:

• 开发的框架使得在现有研究有限的情况下,为兽医疾病创建有针对性的NGS小组.
• 这种方法可以改善兽医药物的药物标发现和患者护理.
• 强调了比较基因组学在促进动物健康方面的潜力.