单细胞和大批RNA测序揭示了乳头甲状腺癌淋巴结转移中的异质性和诊断标记
D-N Lu1,2, W-C Zhang1,2, Y-Z Lin2
1Otolaryngology & Head and Neck Center, Cancer Center, Department of Head and Neck Surgery, Zhejiang Provincial People's Hospital (Affiliated People's Hospital, Hangzhou Medical College), Hangzhou, 310014, Zhejiang, People's Republic of China.
Journal of endocrinological investigation
|December 25, 2023
概括
这项研究通过分析单细胞和散装RNA测序数据,确定S100A2和DIO2是乳头甲状腺癌淋巴结转移 (PTC LNM) 的关键诊断标志物. 发现过度表达DIO2可以抑制PTC细胞增殖和瘤生长.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 基因组学就是基因组学.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 乳头甲状腺癌 (PTC) 经常表现为淋巴结转移 (LNM),影响患者的预后和复发率.
- 了解推动PTC LNM的分子机制对于开发有效的诊断和治疗策略至关重要.
研究的目的:
- 通过单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和散装RNA测序 (RNA-seq) 来识别PTC LNM的新型诊断标记.
- 基于分子分析,探索PTC LNM的潜在治疗点.
主要方法:
- 分析了scRNA-seq和大量RNA-seq数据,以确定PTC LNM中差异表达基因 (DEG).
- 使用交叉的DEG构建了一个诊断模型,并选择S100A2和DIO2进行验证.
- 量化逆转录聚合酶链反应 (RT-qPCR),免疫组织化学 (IHC) 和功能分析 (细胞增殖,细胞循环,异种移植) 用于验证发现.
主要成果:
- 描述了PTC LNM的异质性,为诊断模型揭示了19个DEG.
- 在LNM组织中,S100A2和DIO2在RNA和蛋白质水平上显示出显著的差异表达.
- 在PTC细胞中过度表达DIO2减少了增殖,在G2/M阶段阻止了细胞,并在异种移植中抑制了瘤生长.
结论:
- scRNA-seq和RNA-seq有效阐明了PTC LNM的异质性.
- 证实S100A2和DIO2是PTC LNM的有前途的诊断标记物.
- DIO2证明了抑制PTC细胞增殖和瘤生长的治疗潜力.
