波德特拉百日咳的分子进化和日益增长的宏抗性,上海,中国,2016-2022年

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 遗传学 遗传学 是一个
• 流行病学 流行病学

背景情况:

• 耐宏杆菌百日咳 (MRBP) 构成了全球重大公共卫生威胁.
• 在各种年龄组中观察到百日咳疫情,需要持续监测.

研究的目的:

• 调查上海 Bordetella pertussis 隔离物的遗传特征和流行病学趋势.
• 为了识别Bordetella pertussis中宏类耐药性的出现和传播.

主要方法:

• 在2016年至2022年期间,收集和分析了283个Bordetella pertussis隔离物.
• 检测23S rRNA基因A2047G突变的宏类耐药性.
• 多位数变量数组重复分析 (MLVA) 和病毒性基因型定型.
• 代表性菌株的全基因组测序.

主要成果:

• 2020年之后,百日咳病例从婴儿转移到老年儿童.
• 在Bordetella pertussis中,宏类耐药性从2016年的36.4%显著增加到2022年的97.2%.
• 2020年左右观察到一个遗传转变,MLVA类型28的ptxP3-MRBP菌株取代了MLVA类型195的ptxP1-MRBP菌株.

结论:

• 2020年标志着上海抗宏类百日咳 Bordetella pertussis 演变的一个关键转折点.
• 特定基因型 (ptxP3/MT28) 的出现正在推动MRBP最近的传播.
• 持续的基因组和流行病学监测对于控制百日咳复发至关重要.