网络药理学,分子对接和分子动力学模拟基于基架的化合物,准乳腺癌受体
Noor Zafirah Ismail1, Melati Khairuddean1, Sadiq Abubakar1,2
1School of Chemical Sciences, Universiti Sains Malaysia, Penang, Malaysia.
Journal of biomolecular structure & dynamics
|December 27, 2023
概括
石支架化合物通过与EGFR和ESR1.1等关键蛋白相互作用,显示出对抗乳腺癌的潜力. 分子对接确定了化合物211作为进一步开发抗乳腺癌药物的有希望的候选者.
科学领域:
- 药用化学 医学化学
- 计算生物学 计算生物学
- 在瘤学瘤学.
背景情况:
- 石脚架化合物表现出有前途的抗癌活性.
- 石墨烯化合物和乳腺癌蛋白之间的分子相互作用尚未得到充分理解.
研究的目的:
- 用计算方法研究石墨板架化合物与乳腺癌点的分子相互作用.
- 为了确定乳腺癌治疗的潜在化合物.
主要方法:
- 使用了网络药理学,分子对接和分子动力学 (MD) 模拟.
- 化合物从ASINEX数据库中选,根据Lipinski规则和毒性进行过.
- 蛋白质与蛋白质相互作用 (PPI),基因本体学 (GO) 和KEGG通路分析在确定目标上进行.
主要成果:
- 鉴定了342种石墨烯基支架化合物,其中10种被选择进行进一步分析.
- 确定了四个关键的与乳腺癌相关的目标基因.
- 化合物211对EGFR,FGFR1,ESR1和CDK6具有很高的结合亲和力.
- MD模拟证实了化合物211与其标蛋白的稳定性.
结论:
- 化合物211显示出作为抗乳腺癌剂的显著潜力,这是由于它与多种与癌症相关的蛋白质的强烈相互作用.
- 这些发现为开发用于乳腺癌的基于石墨烯的新疗法提供了基础.
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