单细胞转录组分析揭示了TKI耐药肺癌中POSTN CAFs和ACKR1 ECs之间的免疫抑制网络
Zhiyi Wang1, Ning Yan1, Hailong Sheng1
1Department of Radiation Oncology, Nanfang Hospital, Southern Medical University, Guangzhou, P.R. China.
Cancer genomics & proteomics
|December 27, 2023
概括
这项研究确定了与非小细胞肺癌 (NSCLC) 药物耐药性相关的特定内皮细胞 (EC) 和癌症相关纤维细胞 (CAF),这些细胞被用氨酸激酶抑制剂 (TKIs) 治疗. 这些发现为瘤微环境中的TKI抵抗机制提供了新的见解.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 氨酸激酶抑制剂 (TKI) 治疗是高级非小细胞肺癌 (NSCLC) 的首要治疗方法.
- 耐药性是NSCLC治疗的一个重大挑战.
- 瘤微环境 (TME),包括内皮细胞 (EC) 和癌症相关纤维细胞 (CAF),影响治疗结果,但其在TKI耐药性中的作用尚未完全理解.
研究的目的:
- 调查TME内的EC和CAF亚群及其与NSCLC中TKI治疗耐药性的关联.
- 确定在TKI治疗过程中出现并导致疾病进展的特定EC和CAF亚型.
主要方法:
- 分析 49 个在不同治疗阶段的先进NSCLC样本中单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 数据 (天真,部分响应,疾病进展).
- 使用KEGG和GO分析对EC和CAF亚群的聚类和功能注释.
- 使用DoRothEA和scMetabolism识别关键的转录因子和代谢途径.
- 使用CellChat进行治疗阶段间细胞间通信的比较.
主要成果:
- 确定了七个EC亚群,其中OIT3EC与部分反应相关,ACKR1EC在进展性疾病中流行,表现出增强的细胞粘附.
- 确定了七个CAF亚群,其中PLA2G2ACAF在部分反应中占主导地位,POSTNCAF在进展性疾病中占主导地位,表现出免疫调节性质和增加原分泌.
- ACKR1 ECs通过CD39通路与巨细胞相互作用,POSTN CAFs分泌Tenascin-C (TNC),促进恶性上皮细胞在疾病进展阶段的进展.
结论:
- POSTN CAFs和ACKR1 ECs被确定为关键的细胞组件,与NSCLC中对TKI治疗的耐药性有关.
- 这些发现强调了特定EC和CAF亚群在调解TKI耐药性的关键作用,并建议TME内的潜在治疗点.
