在密苏里州的废水中观察到的神秘SARS-CoV-2的持续选择
Devon A Gregory1, Clayton Rushford1, Torin Hunter1
1Department of Molecular Microbiology and Immunology, University of Missouri-School of Medicine, Columbia, Missouri, United States of America.
PLoS pathogens
|December 28, 2023
概括
污水监测检测到密苏里州的一个神秘的SARS-CoV-2血统,它继续演变. 这种持续的进化表明,与其他主要变种 (如Omicron) 相似的选择性压力.
科学领域:
- 环境微生物学环境微生物学
- 病毒学 病毒学
- 公共卫生监督是对公共卫生的监督.
背景情况:
- 基于废水的流行病学 (WBE) 对于监测SARS-CoV-2循环至关重要.
- 在临床样本中未被检测到的神秘的SARS-CoV-2血统可以在社区中持续存在.
- 之前的WBE研究已经确定了来自特定地理位置的独特血统.
研究的目的:
- 追踪在废水中检测到的特定神秘SARS-CoV-2血统的持续存在和演变.
- 了解隐秘血统的进化动态,以应对选择性压力.
- 评估WBE在识别和监测新型或未表征的病毒菌株方面的实用性.
主要方法:
- 来自特定地点的废水样本的深度测序.
- 遗传学分析来追踪血统演变.
- 进化模式与已知的SARS-CoV-2变体的比较.
主要成果:
- 在密苏里州的一处废水站点中,一系列以前已识别的神秘的SARS-CoV-2血统被反复检测到.
- 这种神秘的血统表现出持续的进化.
- 观察到的进化轨迹与已知的Omicron血统相似.
结论:
- 隐秘的SARS-CoV-2血统可以在社区内持续和演变.
- 废水监测是有效的检测和监测这些血统.
- 这种神秘血统的演变表明,它正处于与全球占主导地位的变种相似的选择性压力之下.
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