从尼日利亚档案生物检查中,从形式素固定型氨酸嵌入型淋巴瘤活检中提取的核酸的质量和数量
I C Uzoma1, I A Taiwo2, N I Ugwu3
1Department of Medical Laboratory Science, Faculty of Health Sciences and Technology, Molecular Hematology and Immunogenetics Laboratory, College of Medicine, University of Nigeria, Enugu Campus, Nsukka, Nigeria.
Nigerian journal of clinical practice
|December 29, 2023
概括
从归档的甲固体嵌入式 (FFPE) 淋巴瘤活检中获得的核酸质量和数量,无论储存时间如何,都保持一致. 这一发现支持使用长期存储的FFPE样本用于癌症研究和诊断.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 病理学 病理学 病理学
背景情况:
- 来自甲固定嵌 (FFPE) 癌症样本的核酸的完整性对于准确的诊断,预后和治疗决策至关重要.
- 存储时间是影响从FFPE组织中提取的核酸质量和数量的已知因素.
研究的目的:
- 研究储存时间对从尼日利亚存档的FFPE淋巴瘤活检中提取的核酸 (DNA和RNA) 的质量和数量的影响.
- 评估长期存储的FFPE样本是否适合分子分析.
主要方法:
- 对53个FFPE淋巴瘤活检 (2008-2019) 的分析,包括慢性淋巴细胞白血病 (CLL),霍奇金淋巴瘤 (HL) 和扩散大B细胞淋巴瘤 (DLBCL,NOS).
- 使用BIOMED-2聚合酶连锁反应 (PCR) 协议进行DNA提取和完整性和放大能力的评估.
- 从CLL病例的一个子集中提取RNA,用于RNU43.43的定量PCR (qPCR) 分析.
主要成果:
- 提取的DNA在所有样本中产生了高达200bp的可放大产品.
- RNA分析表明,循环值 (CT) 值在38以下是一致的.
- 根据储存时间,没有观察到DNA或RNA产量和纯度 (A260/A280比) 的显著变化.
结论:
- 从FFPE淋巴瘤组织中提取的核酸存储时间不同 (长达11年) 保持了可比产量和质量.
- 存储时间似乎不会显著影响这些归档的FFPE淋巴瘤标本中的核酸的质量和数量.
- 这些发现证实了长期存储的FFPE样本用于分子诊断和淋巴瘤研究的可靠性.
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