综合的泛癌分析揭示了TRIB3在免疫微环境调节中的显著预后价值和潜在作用
Chao Hu1, Qingzhou Li1, Lei Xiang2
1State Key Laboratory of Southwestern Chinese Medicine Resources, School of Pharmacy, Chengdu University of Traditional Chinese Medicine, Chengdu 611137, China.
Computational and structural biotechnology journal
|January 1, 2024
概括
假酶TRIB3在24种癌症类型中表达高,与预后不佳和免疫抑制相关. 它的功能丧失促进了抗瘤免疫力,这表明TRIB3是潜在的癌症生物标志物和免疫治疗点.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 癌症基因组学 癌症基因组学
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 伪酶TRIB3在癌症中的作用在各种癌症类型中仍然很大程度上未被描述.
- 之前的研究集中在特定癌症中的TRIB3,限制了对其泛癌功能的全面理解.
研究的目的:
- 在泛癌情境中研究TRIB3的综合功能.
- 在33种癌症类型中分析TRIB3表达,预后,遗传变化及其与瘤免疫微环境 (TIME) 的关联.
主要方法:
- 在33种癌症类型中对TRIB3表达,生存数据和遗传改变 (突变,拷贝数变异,甲基化) 的综合分析.
- 在TRIB3表达和瘤突变负担 (TMB),微卫星不稳定性 (MSI),DNA不匹配修复 (MMR) 基因和免疫细胞透之间进行相关性分析.
- 在乳腺癌细胞系中进行功能丰富分析和验证.
主要成果:
- 在24种癌症类型中,TRIB3的表达很高,并且与不良预后有关.
- 在22种癌症类型中,TRIB3表现出突变,经常出现误解突变和放大,在14种癌症类型中表现出改变的DNA甲基化.
- TRIB3表达与免疫相关的基因组变化 (TMB,MSI,MMR) 和免疫抑制细胞透 (CD4+ Th2,MDSCs) 相相关,可能会产生"冷"瘤.
- 丧失TRIB3功能抑制了增殖,促进了亡,并丰富了乳腺癌细胞中的"热"瘤免疫路径.
结论:
- 在人类癌症中,TRIB3起着至关重要的作用,影响预后和时间调节.
- TRIB3表达与免疫抑制性瘤微环境有关.
- TRIB3 是一种潜在的预后生物标志物,也是癌症免疫治疗的有前途的治疗标.
更多相关视频
07:47Author Spotlight: Unveiling Transmembrane Protein Family-Related Markers in Gastric Cancer and Implications for Targeted Therapies
Published on: September 15, 2023
1.5K
09:40Author Spotlight: Unveiling the Role of TMOD3 in Platinum Resistance and Immune Infiltration in Ovarian Cancer
Published on: August 2, 2024
2.7K
