在Malus domestica中对BURP域含有的基因进行全基因组识别和表达分析
Jiaxuan Ren1, Li Feng1, Lili Guo1
1College of Horticulture, Gansu Agricultural University, Lanzhou, 730070 People's Republic of China.
概括
这项研究在果中发现了18个含有BURP的基因,揭示了它们在植物生长和应激反应中的作用. 关键基因在非生物压力下显示差异性表达,为果提供了洞察力.
科学领域:
- 植物分子生物学 植物分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 含有BURP的蛋白质对植物生长,发育和应激反应至关重要.
- 对果BURP蛋白的系统性表征是有限的.
研究的目的:
- 在果基因组中识别和分析所有含有BURP的基因.
- 使用生物信息学和实验方法检查它们的表达模式.
主要方法:
- 在果中全基因组识别BURP基因.
- 生物信息分析:基因结构,基因图案,cis作用元素,染色体定位.
- 表达式分析:在非生物压力下 (NaCl,PEG) 的组织特异表达和qRT-PCR.
主要成果:
- 在果基因组中发现了18个含有BURP的基因.
- 蛋白质具有保留的C端结构,并含有植物激素/应激反应元素.
- 在各种组织和盐/干旱压力下观察到不同的表达,MdRD7显示出显著的上调.
结论:
- 提供了果BURP蛋白的全面目录和表达特征.
- 突出了BURP基因在果对非生物压力的反应中的作用.
- 为未来对果BURP蛋白的功能研究奠定了基础.
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