使用两个算法识别乳腺癌患者与更年期状态相关的基因和途径
Minzhang Cheng1,2, Lingchen Wang3, Yanlu Xuan1
1Jiangxi Clinical Research Center for Respiratory Diseases, Jiangxi Institute of Respiratory Disease, the Department of Respiratory and Critical Care Medicine, The First Affiliated Hospital, Jiangxi Medical College, Nanchang University, Nanchang, Jiangxi, 330006, China.
BMC women's health
|January 3, 2024
概括
这项研究确定了762个与乳腺癌患者更年期状态相关的差异表达基因 (DEGs). 这些基因参与关键途径,为基于更年期状态的向乳腺癌治疗提供了洞察力.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 更年期状态影响性激素水平,影响雌激素受体 (ER) 和孕激素受体 (PR) 活性,对乳腺癌的发展至关重要.
- 绝经前期和绝经后期乳腺癌患者之间的显著分子水平差异在很大程度上仍未定义.
研究的目的:
- 识别和描述与乳腺癌中更年期状态相关的差异表达基因 (DEGs).
- 探索这些DEG的功能途径和潜在的治疗点.
- 研究这些基因在乳腺癌患者的预后影响.
主要方法:
- 利用了八个基因表达综合 (GEO) 数据集,使用MAMA和LIMMA方法识别DEG.
- 进行了基因本体学 (GO) 和基因和基因组的京都百科全书 (KEGG) 路径丰富分析.
- 构建了蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络,并分析了针对可向基因的DrugBank数据;进行了生存分析.
主要成果:
- 确定了762个与乳腺癌中更年期状态相关的DEG.
- PPI网络分析显示,PPI参与细胞循环,卵细胞半细胞分裂和孕激素介导的卵细胞成熟途径.
- 几种已识别的基因是可向的,与患者的存活相关,突出了它们在多个信号通路中的潜在作用.
结论:
- 在乳腺癌患者中确定了与更年期状态相关的DEG.
- 与关键途径的鉴定基因关联增强了对乳腺癌复杂性的理解.
- 研究结果为开发针对乳腺癌患者更年期状况的新型治疗策略提供了宝贵的见解.
