来自巴基斯坦南部旁遮普邦的E型肝炎病毒的分子鉴定和基因定型
Muhammad Muddassir Ali1, Mehek Gul2, Muhammad Imran2
1Institute of Biochemistry and Biotechnology, Faculty of Biosciences, University of Veterinary and Animal Sciences, Lahore, Pakistan. muddassir.ali@uvas.edu.pk.
Scientific reports
|January 3, 2024
概括
肝炎E病毒 (HEV) 基因型1正在巴基斯坦传播,在旁遮普省南部56%的疑似患者中确诊. 这一发现有助于在该地区诊断和控制HEV.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 公共卫生 公共卫生
- 分子流行病学分子流行病学
背景情况:
- 肝炎E病毒 (HEV) 感染是全球重要的健康问题,特别是在巴基斯坦流行.
- HEV包括四种基因型 (HEV-1至HEV-4),其中HEV-1和HEV-2与卫生条件不佳地区的人类感染有关,而HEV-3/HEV-4是动物传染的.
研究的目的:
- 确定 HEV 在巴基斯坦南部旁遮普地区的流行率和遗传特征.
- 在疑似人类感染中识别循环的HEV基因型.
主要方法:
- 来自穆尔坦区50名患者的血清样本使用ELISA进行了HEV IgM抗体查.
- 从ELISA阳性样本中提取HEV RNA,用于HEV ORF2基因的嵌套PCR放大.
- 测序了PCR产品,并进行了家族遗传分析,以使用MEGA X软件构建一个进化树.
主要成果:
- 在疑似患者中,抗HEV抗体的血清阳性率为56% (28/50).
- 所有已识别的巴基斯坦HEV分离体都与HEV基因型1表现出同质性.
- 遗传学分析显示,与伦敦,法国和日本的HEV基因型1分离物具有共同的进化起源.
结论:
- 肝炎E病毒基因型1正在巴基斯坦积极传播.
- 遗传特征为南旁遮普州的HEV诊断和控制提供了关键数据,重点关注流行基因型.
