从转录性因果网络中获得的基因签名使结直肠癌患者分层化,以获得有效的向治疗

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 基因组学就是基因组学.
• 生物信息学是一种生物信息学.

背景情况:

• 基因签名可以个性化癌症治疗.
• 了解基因相互连接对于识别预测和预后生物标志物至关重要.

研究的目的:

• 在转移性结直肠癌 (CRC) 中识别转录因果关系网络.
• 发现基于整体存活率 (OS) 的患者分层的新型基因特征.
• 为了发现个性化CRC治疗的潜在生物标志物.

主要方法:

• 综合生殖系基因型和瘤RNA测序数据来自1,165名转移性CRC患者.
• 构建了转录基因因果网络以确定基因相互连接性.
• 将网络属性与整体存活率 (OS) 联系起来,并在外部队列中验证了签名.

主要成果:

• 在 cetuximab 和 bevacizumab 治疗下,与整体存活 (OS) 相关的确定的基因特征.
• 发现了与伤口愈合,巨细胞和细胞毒性相关的签名.
• 在外部队列中验证了bevacizumab治疗特征,并证实了瘤与正常组织中的基因下调.

结论:

• 来自转录组因果网络的基因签名可以通过整体存活率 (OS) 来分层转移性结直肠癌 (CRC) 患者.
• 这种方法确定了针对个性化CRC治疗的新型预后生物标志物.
• 已识别的基因及其蛋白质产物在功能上是相关的,并在网络中相互作用.