在婴儿期殖民人类肠道的健康相关细菌联盟的菌株级特征

科学领域:

• 微生物组研究的研究.
• 婴儿发育婴儿的发展.
• 计算生物学是一种计算生物学.

背景情况:

• 人的肠道微生物组在婴儿时期经历了快速发展,与免疫系统成熟相吻合.
• 了解早期生活中的微生物组动态和跨人群的概括模式仍然有限.
• 婴儿肠道微生物组的发展是建立长期健康的关键窗口.

研究的目的:

• 为了研究婴儿肠道微生物组在生命的前六个月的生长动态.
• 确定婴儿微生物组发育中的可概括模式.
• 发现新的微生物群落及其对婴儿健康的潜在影响.

主要方法:

• 在每月间隔15名婴儿队列中的婴儿便样本 (n=94) 上进行了元基因组测序.
• 增强了7项已发表的研究数据,总计来自1,162名婴儿的4,441个元基因组.
• 使用菌株级de novo分析来识别丰富的生物和微生物联盟.

主要成果:

• 确定了592种丰富的生物和以前未被认可的微生物联盟与相关的丰度.
• 发现了一种新的Enterobacterales联盟,与囊性纤维化婴儿的体重增加有积极的相关性.
• 在第一年观察到社区稳定性增加,但在早期几个月显著的微生物变异性.

结论:

• 通过增加新的队列数据来增加现有数据集,可以识别与强大的人类发展相关的新生物群.
• 假设这些已识别的微生物联盟,总的来说,可能会对人类健康产生重大影响,可能超出单个物种的影响.
• 幼儿微生物组的组成和动态对于婴儿的健康结果和发育至关重要.