PBITV3:一种强大而全面的工具,用于选致病蛋白质组的药物标,并优先考虑候选疫苗
Shuvechha Chakraborty1, Mehdi Askari2, Ram Shankar Barai3
1Biomedical Informatics Centre, ICMR-National Institute for Research in Reproductive and Child Health, Mumbai, Maharashtra, India.
Protein science : a publication of the Protein Society
|January 3, 2024
概括
目标识别管道构建器 (PBIT) 工具加速了针对传染病的药物发现. 它的最新版本PBITv3集成了系统生物学和免疫信息学,以加强对抗超级细菌的药物和疫苗目标的识别.
科学领域:
- 计算生物学是一种计算生物学.
- 药物发现 药物发现
- 传染病研究传染病研究.
背景情况:
- 耐药病原体的增加需要新的药理干预措施.
- 公共可用的病原体蛋白质组使得高通量药物标识成为可能.
- 现有的工具需要更新,以解决复杂的生物系统和免疫反应.
研究的目的:
- 以先进的系统生物学和免疫信息学功能更新管道构建器以识别目标 (PBIT) 工具.
- 提高药物和疫苗针对广泛的病原体的目标发现的加速.
- 使用Mycobacterium结核病抗原验证更新的PBITv3工具.
主要方法:
- 综合比较基因组学,减去基因组学,本质性/病毒性和药物分析.
- 纳入系统生物学和免疫信息学模块.
- 使用文献中记录的48种Mycobacterium结核病抗原进行验证.
主要成果:
- PBITv3为药物和疫苗目标识别提供了增强的能力.
- 该工具已经成功地对Mycobacterium tuberculosis进行了验证.
- PBITv3支持新兴耐药传染病原体的药物发现.
结论:
- 更新的PBITv3工具显著增强了传染病的药物发现管道.
- PBITv3提供了一个具有成本效益和高效的平台,用于识别新药和疫苗目标.
- 免费访问的PBITv3工具将帮助研究人员打击抗菌素耐药性和未来的流行病.


