多重反应监测试验用于从20只小鼠器官和组织中大规模定量蛋白质

科学领域:

• 蛋白质组学是指蛋白质组学.
• 生物技术是生物技术.
• 哺乳动物模型模型

背景情况:

• 鼠是研究人类疾病的关键哺乳动物模型.
• 对于推进翻译研究,小鼠的定量蛋白质组数据至关重要.

研究的目的:

• 设计和验证20只小鼠组织中2118种蛋白质的定量质谱分析.
• 为了建立三个常见的小鼠菌株的基线蛋白质丰度数据.
• 为利用小鼠模型的研究人员创建一个可访问的资源.

主要方法:

• 开发和验证了多重反应监测质谱法 (MRM-MS) 试验.
• 在C57BL/6NCrl,NOD/SCID和BALB/cAnNCrl小鼠菌株的20个组织上进行了蛋白质量测量.
• 测试的技术细节和蛋白质丰度数据已公开.

主要成果:

• 经验证的MRM-MS测定了20个小鼠组织中的2118种独特蛋白质.
• 建立了三种不同的小鼠菌株的基线蛋白质丰度测量.
• 鉴定和描述了蛋白质水平的性别和菌株特异性差异.
• 创建了MouseQuaPro数据库 (http://mousequapro.proteincentre.com) 来访问数据.

结论:

• 开发的定量分析和基线蛋白质组数据是小鼠模型研究的宝贵资源.
• 这项工作有助于在小鼠中进行标准化蛋白质基因分析,支持对人类健康和疾病的研究.
• 对方法和数据的开放访问促进了可重复性和科学界更广泛的采用.