快速去除文物和H&E染色组织细分
B A Schreiber1,2, J Denholm3,4,5, F Jaeckle3,5
1Department of Pathology, University of Cambridge, Tennis Court Road, Cambridge, CB2 1QP, Cambridgeshire, UK. bas43@cam.ac.uk.
Scientific reports
|January 3, 2024
概括
本研究介绍了一种简单,快速的方法,在全幻灯片图像 (WSIs) 中对血素和乙素 (H&E) 染色组织进行细分. 该技术有效地删除了不需要机器学习的文物,改进了WSI分析.
科学领域:
- 数字病理学数字病理学
- 计算病理学计算病理学
- 图像分析 图像分析
背景情况:
- 全幻灯片成像 (WSI) 对数字病理学至关重要.
- 在H&E染色的WSIs中的文物可以阻碍准确的分析.
- 现有的细分方法可能会与各种工件发生冲突.
研究的目的:
- 开发一种快速而强大的方法,用于在WSIs中对H&E染色组织进行细分.
- 为了消除常见的文物,如笔痕和扫描问题.
- 为复杂的机器学习方法提供替代方案.
主要方法:
- 使用了WSIs的低放大RGB概述的单通道表示.
- 采用像素值双模式来区分组织和文物.
- 在操纵的色彩空间表示上应用了Otsu值.
主要成果:
- 在30个不同的WSI中,成功地对29个H&E染色组织进行了细分,并在30个WSI中删除了文物.
- 在文物移除方面表现优于Otsu值和Histolab工具.
- 从各种机构和扫描仪的WSIs中证明了高效率.
结论:
- 拟议的方法提供了一个简单而有效的解决方案,用于在WSIs中的H&E染色组织细分.
- 在没有机器学习或参数调整的情况下,可以快速删除文物.
- 这种方法提高了WSI分析在数字病理学中的可靠性.
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