在lmb集群之外的三个新的LmbU目标抑制了Streptomyces lincolnensis中的林氏素生物合成
Yue Mao1,2, Xianyan Zhang1,2, Tianyu Zhou1,2
1State Key Laboratory of Bioreactor Engineering, East China University of Science and Technology, Shanghai, China.
Microbial cell factories
|January 3, 2024
概括
像LmbU这样的集群式调节器控制抗生素生产. 这项研究揭示了LmbU直接调节林氏素集群之外的基因,影响生物合成并提供级联调节模型.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 分子生物学分子生物学
- 遗传学 遗传学 是一个
背景情况:
- 抗生素生物合成通常由同一生物合成基因集群 (BGC) 内的集群定位调节基因 (CSRGs) 控制.
- 此前,LmbU已被确定为林氏素生物合成的CSR.
- 位于各自BGC之外的CSR目标的监管机制尚不清楚.
研究的目的:
- 调查林氏素BGC之外的LmbU的监管目标.
- 阐明这些外部标在林氏素生物合成中的作用.
- 建立涉及LmbU和外基监管机构的监管网络.
主要方法:
- 在Streptomyces lincolnensis中对LmbU目标进行全基因组选.
- 电泳运动转移试验 (EMSA) 证实LmbU与候选点的直接结合.
- 记者测定和基因干扰研究,以评估对林氏素生产和lmb基因转录的影响.
- 定量逆转录PCR (qRT-PCR) 用于分析基因表达水平.
主要成果:
- 在基因组中确定了14个LmbU候选点,其中8个通过EMSA确认结合LmbU.
- 发现LmbU可以抑制SLINC_0469和SLINC_1037的转录,同时激活SLINC_8097的转录.
- 干扰SLINC_0469,SLINC_1037和SLINC_8097增强了林氏素的产生,并抑制了lmb基因转录,表明这三个基因对林氏素生物合成的负调节.
结论:
- LmbU直接调节位于林氏素生物合成基因集群外的基因.
- 这些外基因标在调节林氏素生物合成和林氏素基因的转录中发挥着重要作用.
- 这项研究建立了一个涉及LmbU和外基调节器的新型级联调节电路,为未来对LmbU家族蛋白质的研究提供了基础.
