识别肺腺癌和牙周炎之间的交叉基因
Pengcheng Wang1, Hui Yu2, Xiaoli Gao1
1Department of Stomatology, Beijing Chaoyang Hospital, Capital Medical University, Beijing, 100000, China.
Current medicinal chemistry
|January 4, 2024
概括
这项研究确定了FKBP11和MMP13作为关键的交叉基因,将牙周炎和肺腺癌 (LUAD) 联系起来. 这些基因会影响免疫细胞的活动,为这些疾病的并发症提供新的见解.
科学领域:
- 基因组学和生物信息学
- 癌症研究 癌症研究
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 肺腺癌 (LUAD) 是一个主要的健康问题,吸烟与LUAD和牙周炎有关.
- 牙周炎和LUAD之间的确切关系尚不清楚.
- 了解这种联系对于制定有效的预防和治疗策略至关重要.
研究的目的:
- 确定牙周炎和LUAD之间共享的分子机制 (交叉基因).
- 开发基于这些交叉通话基因的LUAD诊断模型.
- 研究这些基因对免疫反应和细胞过程的影响.
主要方法:
- 利用TCGA和GEO数据库中的RNA表达数据来识别牙周炎和LUAD中的差异表达基因 (DEG).
- 构建的蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络以识别交叉DEG和子网络.
- 采用递归特征消除 (RFE) 和支持矢量机器 (SVM) 来进行特征选择和诊断模型开发.
主要成果:
- 根据网络拓和算法分析,确定了29个交叉DEG,FKBP11和MMP13被选为关键交叉基因.
- 使用FKBP11和MMP13开发了一个诊断模型,证明了LUAD的高诊断精度.
- 发现FKBP11和MMP13显著影响巨细胞 (M1),CD8T细胞活性,免疫相关途径和细胞循环途径.
结论:
- FKBP11和MMP13被确定为关键交叉基因,连接牙周炎和LUAD.
- 这些基因通过调节免疫细胞活动和相关途径来调节并发症.
- 这些发现为牙周炎和LUAD之间的关联提供了分子基础,表明了潜在的治疗点.
