英国预警期间侵袭性Streptococcus pyogenes感染的流行病学变化:2023年西班牙一家三级医院的分子比较分析

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 基因组学就是基因组学.
• 流行病学 流行病学

背景情况:

• 血流感染Streptococcus pyogenes (GAS-BSI) 构成了严重的公共卫生威胁.
• 英国在2022-2023年经历了侵入性GAS爆发警报.
• 了解当地基因组流行病学对于有效的监测和应对至关重要.

研究的目的:

• 在西班牙一家三级医院调查GAS-BSI的基因组流行病学.
• 为了将发现与英国入侵性S. pyogenes爆发警报数据进行比较.
• 描述循环中的S. pyogenes菌株及其毒性因子.

主要方法:

• 从2017年到2023年对GAS-BSI病例进行了回顾性分析.
• 孤立的S. pyogenes菌株的全基因组测序 (WGS).
• 超抗原基因 (speA, speC, speG, speJ) 的类型和鉴定.

主要成果:

• 与前几年相比,在2023年观察到GAS-BSI病例的增加.
• emm1和emm12是主要的emm类型,emm1分离物经常属于M1克隆.
• speG,speC,speJ和speA是检测到的最常见的超抗原基因,speA和speJ在M1克隆中普遍存在.

结论:

• 2023年西班牙GAS-BSI的基因组流行病学与英国的疫情数据一致.
• 这些发现与之前的国家S. pyogenes监测报告有所不同.
• 基因组监测对于追踪正在演变的S. pyogenes菌株和为公共卫生战略提供信息至关重要.