转录基因分析确定B-淋巴细胞激酶是去塑性小圆细胞瘤癌干细胞样细胞的治疗标

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 分子生物学分子生物学
• 遗传学 是一个遗传学.

背景情况:

• 形小圆细胞瘤 (DSRCT) 是一种由EWSR1-WT1融合基蛋白驱动的侵袭性儿科癌症.
• 目前的治疗方法在很大程度上是无效的,其5年生存率很低,这凸显了对新型治疗策略的需求.
• 癌症干细胞类型 (CSC类型) 的DSRCT模型表现出增加的化学抵抗和干细胞标志物表达.

研究的目的:

• 研究在CSC类条件下培养的DSRCT细胞中的转录和表观遗传变化.
• 在化学耐药的DSRCT CSC类细胞中识别新的治疗点.
• 评估针对已识别的CSC丰富路径的治疗潜力.

主要方法:

• RNA测序 (RNA-seq) 来分析CSC类球体和附着的DSRCT细胞之间的基因表达差异.
• ATAC-seq用于识别可访问的染色体区域和表观遗传修饰.
• 途径分析以阐明CSC类DSRCT中改变的生物过程.
• 功能性测试以评估向B-淋巴细胞激酶 (BLK) 的影响.

主要成果:

• RNA-seq揭示了染色体组装/拆卸和细胞结合路径的显著变化.
• ATAC-seq识别了超过1万个差异可访问的基因组区域,包括SOX2基因附近.
• B-淋巴细胞激酶 (BLK) 被确定为一种可药物治疗的,通过EWSR1-WT1.1.调节的CSC丰富的标.
• 抑制或淘汰BLK降低了DSRCT细胞中的CSC类属性和化学抵抗.

结论:

• 表观遗传失调,特别是染色体重塑,在DSRCT CSC类状态中起着至关重要的作用.
• 在DSRCT中,BLK是克服化学抵抗的有希望的治疗标.
• 针对BLK可能会提高DSRCT组合疗法的疗效.