脑外转录学m6A分析显示,在HeLa细胞中瘤亡因子α (TNF-α) 诱导的亡条件下,有明显的m6A标记

科学领域:

• 分子生物学分子生物学
• 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
• 细胞生物学 细胞生物学

背景情况:

• 瘤亡因子-α (TNF-α) 是细胞亡的关键调节剂,涉及复杂的基因调节机制.
• 表体转录学景观,特别是N6-甲基氨酸 (m6A) 标记,在细胞亡过程中由TNF-α调节,仍然在很大程度上未被探索.
• 了解这些修改对于阐明TNF-α诱导的细胞死亡途径至关重要.

研究的目的:

• 在HeLa细胞的TNF-α诱导的亡下,全面地绘制全基因组的m6ARNA修饰.
• 研究METTL3的作用及其与TNF-α在调节mRNA翻译和亡中的相互作用.
• 为了确定与TNF-α介导的细胞死亡相关的特定m6A模式.

主要方法:

• 使用miCLIP-seq进行全基因组分析,以识别m6A修饰RNA.
• 分析mRNA丰度和翻译效率通过多体选.
• 在HeLa细胞中进行METTL3敲除实验,并在斑马鱼异种移植模型中进行验证.

主要成果:

• 鉴定了632个m6A点mRNA,其中99个缩在亡途径中.
• 在TNF-α和西斯普拉丁诱导的亡之间观察到明显的m6A修饰模式.
• 在TNF-α治疗后,METTL3 knockdown特别改变了TP53INP1 mRNA的翻译效率和蛋白质水平.
• METTL3敲除使HeLa细胞对TNF-α诱导的亡敏感,在体内得到证实.

结论:

• 亡途径表现出明显的m6A甲基化模式.
• 一个新的TNF-α-METTL3-TP53INP1轴在调节TNF-α介导的亡中起着重要作用.
• 经转录体调节是TNF-α诱导的细胞死亡的关键组成部分.