脊髓小脑动症2型有多种祖先的起源

科学领域:

• 遗传学 是一个遗传学.
• 神经退行性疾病 神经退行性疾病
• 人口遗传学 人口遗传学

背景情况:

• 2型脊髓小脑动症 (SCA2) 是一种主要的神经退行性疾病,由ATXN2基因的CAG重复扩张引起.
• 以前的研究表明,SCA2在全球范围内只有一种祖先的单一单元型,其标志是rs695871.1.的C等位基因.
• 鉴于疾病的严重程度和预期现象,SCA2祖先单元型的同质性是意想不到的.

研究的目的:

• 识别和描述南美SCA2家族中的有信息的祖先哈普洛类型.
• 在这个人群中调查SCA2的遗传多样性和潜在的多种起源.

主要方法:

• 在77个来自巴西,秘鲁和乌拉圭的SCA2指数病例中使用单核酸多态 (SNP) 和短并列重复 (STR) 的哈普洛型重建.
• 分析包括SNPs rs9300319, rs3809274, rs695871, rs1236900, rs593226,以及STRs D12S1329, D12S1333, D12S1672, D12S1332. 这些数据都被用于分析.
• 在已识别的单元类型中对受影响和正常等位基因之间的CAG重复长度进行比较.

主要成果:

• 在南美洲的SCA2家族中发现了11种不同的祖先类型.
• 最常见的单元类型是A-G-C-C-C (46.7%),G-C-C-C-C (24.6%),以及A-C-C-C-C (10.3%).
• 发现了一种新型的G-C-G-A-T哈普洛型,具有在rs695871处的G等位基因,这与之前发现的全球C等位基因在这个位置的发现相矛盾.

结论:

• 南美SCA2家族表现出显著的单元型多样性,这表明该地区疾病的多个独立起源.
• 在一个罕见的单元型中,在rs695871的G基因组的鉴定表明了与SCA2.2相关的以前未被识别的遗传变异.
• 在全球其他地区进行进一步的研究是有必要的,以充分了解全球起源和多样性Spinocerebellar ataxia类型 2.