在SARS-CoV-2分子测试中使用后存档的核酸的质量和组成
Ho Hyun Song1, Jong Cheul Choi2, Ran Lee2
1Department of Interdisciplinary Program in Biomedical Science, Graduate School, Soonchunhyang University, Asan, Chungcheongnam-do, Republic of Korea.
概括
从归档的SARS-CoV-2逆转录实时PCR (rRT-PCR) 样本中对核酸 (NA) 的质量评估证实了它们适合未来的分子研究. 对于后续的研究,特别是对于短期目标,保证了档案的NA质量.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 病毒学 病毒学
- 核酸分析 核酸分析
背景情况:
- 反转录实时PCR (rRT-PCR) 是检测SARS-CoV-2的标准方法.
- 核酸 (NA) 质量评估通常不需要用于rRT-PCR.
- 这项研究评估了存档的rRT-PCR样本中的NA质量,以了解未来的研究潜力.
研究的目的:
- 从归档的SARS-CoV-2rRT-PCR样本中评估核酸 (NA) 的质量,数量和纯度.
- 确定这些存档的NAs是否适合随后的分子研究.
主要方法:
- 从SARS-CoV-2阳性和阴性病例中提取了NA样本.
- 使用光谱光度和度测量来测量NA的质量,数量和纯度.
- 滴滴数字PCR量化了16SrDNA和RPP30,以表征双链DNA (dsDNA) 的起源和组成.
主要成果:
- 阳性和阴性样本组之间没有观察到RNA完整数 (RIN) 或纯度的显著差异.
- 在这两组中,RNA数量明显高于dsDNA.
- 在阳性样本中,dsDNA和RNA的数量显著更高.
- 16S rDNA副本在两个组的dsDNA中明显大于RPP30,在阳性样本中RPP30水平更高.
结论:
- 在SARS-CoV-2rRT-PCR之后存档的核酸质量足以用于未来的分子研究.
- 这些发现支持使用存档样本进行涉及人类或细菌DNA的研究,特别是用于短期目标.
