调查环境传播,以解决新生儿重症监护病房的Bacillus cereus群爆发,使用核心基因组多部位序列类型化

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 传染性疾病 传染性疾病
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 在IV级新生儿重症监护病房爆发Bacillus cereus群 (Bcg) 疫情的分析.
• 对患者和环境进行了全面的抽样.

研究的目的:

• 在新生儿重症监护病房爆发期间调查Bcg的传播途径.
• 评估高分辨率打字技术的有效性,以解决疫情.

主要方法:

• 来自患者和环境样本的28个Bcg分离物的全基因组测序.
• 开发和应用一个定制的核心基因组多部位序列类型化 (cgMLST) 方案.
• 与稳定的cgMLST方案和单核酸多态性 (SNP) 分析进行比较.

主要成果:

• 确定了多种序列类型,ST127是最常见的.
• 13个ST127分离物中的10个聚合在一起,包括侵入性分离物和环境样本.
• 据SNP分析,一个通风机屏幕是潜在的储.

结论:

• 环境采样对于在NICU等敏感环境中进行疫情分析至关重要.
• 高分辨率的打字技术,如定制cgMLST和SNP分析,对于解决由广泛传播的细菌引起的疫情,如BCG,是必要的.
• 一个定制的cgMLST方案与SNP分析相结合,成功解决了BCG爆发.