单分子实时测序数据集的Hypericum perforatum L.种苗和细胞悬浮培养的单分子实时测序数据集

科学领域:

• 植物基因组学 植物基因组学
• 药理学是指药理学,即药理学是指药理学.
• 生物技术是生物技术.

背景情况:

• 有超过500个物种的Hypericum具有显著的药理和生态重要性.
• 尽管取得了进展,但对于Hypericum物种没有公开的全基因组序列.
• 了解整个组织中的二次代谢物生物可用性对于药物应用至关重要.

研究的目的:

• 为了生成和提供首个公开可用的转录基因数据集Hypericum perforatum.
• 为了能够在Hypericum属内进行比较的转录基因分析.
• 促进对高价值药物化合物的生物合成途径的阐明.

主要方法:

• 使用了单分子实时 (SMRT) 测序.
• 从Hypericum perforatum种子和细胞悬浮培养物中生成了转录组数据.
• 处理了原始测序数据,以获得高质量的转录.

主要成果:

• 从细胞悬浮培养 (20Gb原始数据) 中获得了超过33,000个高质量的转录.
• 超过55,000个高质量的成绩单是从植株 (35Gb原始数据) 中生成的.
• 这代表了任何Hypericum物种的第一个SMRT数据集.

结论:

• 生成的转录基因数据集是Hypericum研究社区的宝贵资源.
• 这些数据将支持比较的转录基因研究和对药物化合物生物合成的调查.
• 这些发现有助于更深入地了解Hypericum的药理价值的遗传基础.