曼蒂斯:高通量4D成像和分析细胞的分子和物理结构
Ivan E Ivanov1, Eduardo Hirata-Miyasaki1, Talon Chandler1
1Chan Zuckerberg Biohub San Francisco, San Francisco, United States.
bioRxiv : the preprint server for biology
|January 8, 2024
概括
曼蒂斯,一个4D显微镜和shrimPy软件使得高通量活细胞成像成为可能. 这个平台允许详细分析细胞动力学和对干扰的反应,推动细胞生物学研究.
科学领域:
- 细胞生物学 细胞生物学
- 显微镜的使用方法
- 生物成像是一种生物成像.
背景情况:
- 高通量动态成像对于理解细胞反应至关重要.
- 活细胞成像技术对于观察动态细胞过程至关重要.
- 分析复杂的细胞动态需要先进的成像和分析工具.
研究的目的:
- 介绍Mantis,一个高通量4D显微镜,集成远程再聚焦无标签显微镜和斜光片光显微镜.
- 介绍shrimPy,一个开源软件,用于高通量4D数据处理和单细胞表型.
- 为了展示Mantis和shrimPy在高内容相关成像和细胞动态分析方面的综合能力.
主要方法:
- 在Mantis平台中整合了远程重新聚焦无标签显微镜和斜光片光显微镜.
- 开发shrimPy软件,用于4D活细胞数据的高通量成像,解卷和表型化.
- 在长时间内对20个细胞系进行分子动力学和细胞架构的相关成像.
主要成果:
- 在20个细胞系中,每15分钟进行7.5小时的高含量相关成像,对分子动力学和物理结构进行高含量相关成像.
- 能够详细测量病毒感染对宿主细胞和蛋白质结构的影响.
- 展示了平台对细胞反应的长期成像和分析的能力.
结论:
- 曼蒂斯平台和shrimPy软件为高通量活细胞成像和分析提供了一个强大的系统.
- 这种集成的平台有助于研究细胞内动力学,细胞对干扰的反应和基因调控网络.
- 能够进行先进的光学选,用于在活细胞中剖析复杂的生物过程.


