大量LMM:使用线性混合模型对多个定量特征进行实时基因组扫描
Zifan Yu1, Gregory Farage1, Robert W Williams2
1Department of Preventive Medicine, University of Tennessee Health Science Center, Memphis, TN 38163, USA.
bioRxiv : the preprint server for biology
|January 8, 2024
概括
研究人员开发了BulkLMM,这是一种用于快速基因组扫描的新算法. 这种方法显著加快了使用线性混合模型 (LMM) 分析众多定量特征的速度,使遗传研究更有效率.
科学领域:
- 遗传学 遗传学 是一个
- 生物信息学是一种生物信息学.
- 计算生物学 计算生物学
背景情况:
- 在遗传研究中,高通量表型化产生了大量的数据集.
- 使用线性混合模型 (LMMs) 分析许多定量特征是计算密集的.
- 目前执行基因组扫描特征逐项的方法耗时.
结论:
- 大量LMM为涉及众多特征的大规模遗传分析提供了高效的解决方案.
- 开发的软件通过大大减少分析时间来加速基因组发现.
- 现有的开源软件有助于在遗传研究中更广泛地采用.


