一个cis调节元件通过自身免疫疾病风险SNP调节ERAP2的表达
Wouter J Venema1, Sanne Hiddingh1, Jorg van Loosdregt2
1Department of Ophthalmology, University Medical Center Utrecht, Utrecht University, Utrecht, the Netherlands; Center for Translational Immunology, University Medical Center Utrecht, Utrecht University, Utrecht, the Netherlands.
在ERAP2基因附近的单核酸多态 (SNP) 影响自身免疫性疾病和感染. 这项研究揭示了LNPEP基因促进体和ERAP2基因中的特定SNP如何通过染色体相互作用调节ERAP2表达.
科学领域:
- 遗传学 遗传学 是一个
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 在ERAP2基因附近的单核酸多态 (SNP) 与自身免疫性疾病和感染结果有关.
- 连接这些SNP与ERAP2表达和疾病的功能机制由于高度链接不平衡,仍然不清楚.
研究的目的:
- 阐明SNP调节ERAP2表达的功能机制.
- 调查 cis 作用变体和远程调节元素在 ERAP2 基因表达中的作用.
主要方法:
- 相互等位基替代以评估ERAP2表达控制.
- 基因特异性构造捕获试验以确定色素相互作用.
- 在LNPEP促进体中SNP操纵以评估对ERAP2表达的影响.
主要成果:
- ERAP2的表达是直接由拼接区域变体rs2248374.4控制的.
- 在LNPEP基因促进体中,与疾病相关的变异独立地影响ERAP2表达.
- LNPEP和ERAP2促进体之间的长距离染色质接触在与疾病相关的等位基因中更强,增加了ERAP2的表达.
结论:
- 多个SNP合作调节ERAP2的表达,影响自身免疫性疾病的易感性.
- 与疾病相关的变体可以将基因促进区转化为远程基因的增强剂,如ERAP2.2.
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