通过基于网络的分析来识别先进的动脉样硬化板中的M2巨相关的关键基因
Yao Yuan1, Peng Wang, Haigang Zhang
1Department of Pharmacology, College of Pharmacy, Army Medical University (Military Medical University), Chongqing, China .
Journal of cardiovascular pharmacology
|January 9, 2024
概括
研究人员确定了六个关键基因 (AKTIP,ASPN,FAM26E,RAB23,PLS3,PLSCR4),这些基因与M2巨细胞在动脉样硬化斑块进展中有关. 这些基因在先进的斑块中下调,为心血管事件提供潜在的治疗点.
科学领域:
- 心血管生物学 心血管生物学
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 动脉样硬化斑块由于其脆弱性,导致主要的不良心血管事件.
- 经典激活 (M1) 和替代激活 (M2) 巨细胞分别影响斑块的进展和回归.
- 与动脉样硬化中M2巨细胞相关的治疗点在很大程度上仍未确定.
研究的目的:
- 在动脉样硬化斑块中识别M2巨相关的枢纽基因.
- 确定与动脉样硬化斑块进展和脆弱性相关的关键基因.
- 评估已识别的关键基因的诊断和治疗潜力.
主要方法:
- 权重基因同表达网络分析 (WGCNA) 应用于GSE43292数据集,以确定与M2巨相关的模块和枢纽基因.
- 在GSE43292数据集上进行了差异基因表达分析.
- 图被用来找到枢纽基因和差异表达基因的交叉点. 用GSE100927和GSE41571数据集以及体外和体内模型进行了验证.
主要成果:
- 构建了一个加权的基因联合表达网络,识别了一个蓝色模块,与高级斑块中的M2巨细胞透有显著的相关性.
- 在蓝色模块中确定了九九个枢纽基因. 与1289个差异表达基因的交叉产生了六个关键基因:AKTIP,ASPN,FAM26E,RAB23,PLS3和PLSCR4.
- 与早期和稳定的斑块相比,这些六个关键基因在先进和脆弱的斑块中被持续下调,显示出潜在的诊断价值和验证的mRNA表达的减少 in vitro 和 in vivo.
结论:
- AKTIP,ASPN,FAM26E,RAB23,PLS3和PLSCR4被确定为与动脉样硬化进展中的M2巨细胞相关的关键基因.
- 这些基因在晚期动脉样硬化斑块中的下调表明它们在斑块脆弱性中的作用.
- 这些已识别的关键基因代表了在先进的动脉样硬化斑块中进行干预的潜在新型治疗点.
